Od 01. 01. 2005. godine svi prihodi koje ubire Uprava za indirektno oporezivanje prikupljaju se na Jedinstveni račun otvoren u Centralnoj banci BiH. Prihode prikuplja 12 za to ovlaštenih komercijalnih banaka koje prikupljeni novac prosljeđuju na račun u Centralnoj banci. Zakonom o uplatama na jedinstveni račun i raspodjeli prihoda određeno je da se prihodi svakodnevno raspoređuju prema koeficijentima koje utvrđuje Upravni odbor Uprave za indirektno oporezivanje. Trenutno važeći koeficijenti, koje je Upravni odbor UIO utvrdio na 90. sjednici od 24. 06. 2008. godine, prema kojima se raspoređuju prihodi za period juli – septembar 2008. godine su slijedeći: • Federacija BiH: 64.39% • Republika Srpska: 32.06% • Brčko Distrikt: 3.55% Na istoj sjednici usvojen je Pravilnik o raspodjeli prihoda sa jedinstvenog računa Uprave za indirektno oporezivanje, koji predviđa utvrđivanje koeficijenata za raspodjelu svaka tri mjeseca, između ostalog, ali nikada nije primjenjen, pa se raspodjela prihoda i dalje vrši po istim koeficijentima. Takođe, nikada nije uspostvaljena Jedinica za krajnju potrošnju, iako je na istoj sjednici donijeta odluka o tome.
